Temizlik, biyolojik güvenlik kabininin etkinliğini sağlamak için kritik öneme sahip temel bir faktördür.Düzenli temizlik, temizliğin korunmasına yardımcı olarak zararlı partiküllerin, bakterilerin ve diğer kirleticilerin potansiyel yayılmasını azaltır.

Biyolojik güvenlik kabinlerinin yapımında kullanılan malzemeler korozyona dayanıklı, kolay temizlenebilir ve bakteri üremesini engelleyecek gözeneksiz olmalıdır.Malzemeler ayrıca gerekli temizleme ve dekontaminasyon prosedürlerine dayanacak kadar dayanıklı olmalıdır.

Tüm BSC, ISO 14644-1 ve EN1822 dahil olmak üzere belirtilen uluslararası standartları karşılamalıdır.Kabinler düzenli olarak test edilmelidir ve talep üzerine test ve temizlik ile ilgili uygun belgeler sunulmalıdır.

Kabinin yapımında kullanılan malzeme ve temizlik, yapılan deneylerin başarısının ve güvenliğinin sağlanmasında en önemli faktörlerden biridir.