Temiz oda döşemesi, bir temiz oda tasarlarken önemli bir husustur.Parçacık oluşumunu en aza indirmek, temizliği kolaylaştırmak ve temiz oda ortamının bütünlüğünü korumak için tasarlanmıştır.Temiz odalarda kullanılan en yaygın döşeme malzemeleri vinil, epoksi ve poliüretandır.

Temiz oda döşemesinin yapısı tipik olarak bir alt zemin, yapışkan katman ve döşeme malzemesinin üst katmanından oluşur.Döşeme malzemesinin üst tabakası, temiz oda sınıfı ve uygulamasının yanı sıra dayanıklılık ve temizlik kolaylığına göre seçilmelidir.Tüm döşeme malzemeleri tüy bırakmamalı, az tüy bırakmalı ve temizleme solüsyonlarından kaynaklanan hasarlara karşı dirençli olmalıdır.

Temiz oda döşemesinin temizliğini korumak için, düzenli bir temizlik ve bakım programı takip etmek önemlidir.Faaliyet düzeyine ve mevcut kirleticilerin türüne bağlı olarak, temizlik ve bakım sıklığı değişebilir.Tüm temizlik, özel ekipman ve temizlik solüsyonları kullanılarak yapılmalı ve döşemenin herhangi bir onarımı veya değiştirilmesi, eğitimli profesyoneller tarafından yapılmalıdır.